病理性肥胖包括的范围比较广，但主要指出于某种疾病引起的肥胖，如柯兴氏综合征、甲减性肥胖、肝炎后肥胖等，单纯性肥胖产生较重要的并发症也意味着肥胖已成为病理性肥胖。
柯兴综合症因素： 肾上腺皮质功效亢进，皮质醇释放太多 情况：脸，脖子和身体肥大，但四肢则脂肪不多。
胰源性因素： 胰岛素释放太多，代谢率降低，使脂肪分解减轻而合成增多 情况： 周身肥胖。
性功效降低因素： 脑性肥胖病，伴有性功效丧失，或性欲减退。情况： 乳房，下腹部，生殖器附近肥胖。
垂体性因素： 脑垂体病变引起垂体前叶释放太多生长激素 情况： 周身骨头，软结构，内脏结构增生和肥大。
甲状腺功效减退因素： 甲状腺功效减退情况： 肥胖和粘液型水肿。
药源性因素： 药物的副作用引起，如由肾上腺皮质激素类药物。 情况：在服药一段功夫后产生的肥胖，例如有些患有过敏性疾病，类风湿病，哮喘病的病人。
而引起肥胖的病理性危险因素则包括以下几点：
(1)某些综合征如肥胖性腺发育不良，多指趾、视网膜炎智力落后综合征;
(2)肥胖相关基因突变如瘦素和瘦素受体、FTO基因突变;
(3)脑部病变如外伤、肿瘤、炎症后;
(4)内释放异常如生长激素缺少症、高皮质醇血症、高胰岛素血症;
(5)活动减轻或障碍如长期卧床、脑瘫;
(6)骨骼生长障碍如软骨发育不良;
(7)药物：如类固醇激素、抗甲状腺药物、胰岛素等。
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